Makrofagi na drodze fagocytozy wchłaniają drobnoustroje na przykład przedstawione na schemacie bakterie. Bakteria wewnątrz makrofaga zostaje rozłożona na fragmenty (strawiona). Pozostałości komórki bakterii zostają wyrzucone poza makrofaga, a fragmenty antygenu są prezentowane na jego powierzchni. Następnie limfocyty Th (pomocnicze) rozpoznają cechy danego antygenu i ulegają aktywacji – wydzielają specjalne białka, które pobudzają limfocyty B. W ten sposób pobudzone limfocyty B intensywnie się dzielą i wszystkie wytwarzają ten sam rodzaj przeciwciał. Ponadto limfocyty B zapamiętują dany antygen, czyli stają się komórkami pamięci, co oznacza, że przy następnym kontakcie z tym antygenem wytworzą przeciwciała odpowiednie dla niego.