Główną różnicą między glikolizą a glukoneogenezą jest kierunek przemian i cel procesów. Glikoliza ma na celu produkcję energii w postaci ATP, natomiast glukoneogeneza służy do produkcji glukozy w warunkach niedoboru glukozy w organizmie. Ponadto, w procesie glikolizy glukoza jest rozkładana do pirogronianu, a w procesie glukoneogenezypirogronian jest syntetyzowany do glukozy.
Glikoliza - proces, w którym glikoza jest przekształcana w pirogronian w celu produkcji energii w postaci ATP. W jej trakcie glikoza jest rozkładana do dwóch cząsteczek kwasu pirogronowego, a w procesie powstają dwie cząsteczki ATP i dwie cząsteczki NADH.
Glukoneogeneza – proces, w którym glukoza jest syntetyzowana z innych związków organicznych w warunkach niedoboru glukozy. Zachodzi głównie w wątrobie i nerkach i odbywa się w drodze odwrotnej do glikozy.