Sprzężenie zwrotne ujemne zapobiega przed nadmiernym zachodzeniem danej przemiany metabolicznej. Polega na hamowaniu działania enzymu katalizującego pierwszy etap szlaku poprzez produkt ostatniej reakcji danego szlaku. Mechanizm ten dodatkowo zabezpiecza komórkę przed niepotrzebnym nagromadzeniem się produktów.
Sprzężenie zwrotne ujemne powoduje, że produkt będzie działał hamująco na enzym. Natomiast w przypadku szlaku metabolicznego, gdzie następuje po sobie kilka kolejnych reakcji, będzie on inhibitorem na jeden z pierwszych enzymów, co będzie chroniło przed nadmiernym zachodzeniem reakcji.