Józef II nadał wolność religijną wszystkim chrześcijanom oraz nie dopuszczał do prześladowań Żydów. Ograniczył również rolę kościoła katolickiego, ponieważ państwo zaczęło prowadzić seminaria dla księży. Doprowadził do kasaty zakonów, które nie przynosiły państwu pożytku – funkcjonować mogły tylko te, które trudniły się edukacją i dobroczynnością.
System polityczny, który podporządkowywał Kościół Katolicki władzy nazywał się józefinizmem. Był on stosowany przez cesarzową Marię Teresę i Józefa II.