Lizosomy biorą udział w trawieniu wewnątrzkomórkowym.
Lizosomy odpowiadają za wewnątrzkomórkowe trawienie cząsteczek pokarmowych dzięki enzymom trawiennym – hydrolazom. Strawione w lizosomach substancje mogą być transportowane do cytozolu, gdzie ponownie zostaną wykorzystane przez komórkę do nowych reakcji syntezy lub usuwane poza nią.