Krzyżówkę genetyczną wykonuje się, aby przewidzieć możliwe genotypy i fenotypy potomstwa. Najczęściej stosuje się do tego tzw. szachownicę Punnetta.
Najpierw zapisuje się genotypy rodziców. Następnie ustala się, jakie gamety może wytworzyć każdy z nich. Każda gameta zawiera tylko jeden allel danego genu.
Potem rysuje się tabelę, w której u góry wpisuje się gamety jednego z rodzica, a z boku gamety drugiego. W powstałych polach wpisuje się możliwe połączenia alleli, czyli genotypy potomstwa.
Na końcu określa się proporcje genotypów i fenotypów w potomstwie.