Pierwotna ściana komórkowa zawiera więcej wody i białek, a mniej celulozy niż ściana wtórna. W przeciwieństwie do ściany pierwotnej ściana ścianazawiera dodatkowe związki stabilizujące jej strukturę takie jak lignina, kutyna i suberyna.
Substancje odkładane we wtórnej ścianie komórkowej:
· Lignina – usztywnia ściany komórkowe i umożliwia pionowy transport wody w roślinie, występuje głównie w komórkach drewna,
· Kutyna – jest składnikiem kutykuli – substancji pokrywającej komórki skórki pędu i liści, zabezpiecza rośliny przed nadmiernym parowaniem wody,
· Suberyna – usztywnia ściany komórkowe korkowicy i zapobiega przenikaniu wody.