1. Gromadzenie wody – wakuole magazynują wodę w komórce, zapewniając jej odpowiedni turgor.
2. Magazynowanie jonów i substancji zapasowych- w wakuolach magazynowane są cukry oraz białka zapasowe.
Wakuole roślinne gromadzą również uboczne produkty metabolizmu komórki, toksyny i inne związki jak np. metale ciężkie, które zostały pobrane przez roślinę. W wakuolach magazynowane są też glikozydy- nadające barwę kwiatom i owocom oraz pełniące funkcję antyoksydacyjne, a także alkaloidy i garbniki, które służą jako substancje ochronne przed szkodnikami.
W komórkach roślinnych występują także wakuole lityczne, które zawierają enzymy trawienne, biorące udział w degradacji zużytych organelli.