Niektóre gatunki szkarłupni, takie jak ogórki morskie, poprzez zakopywanie się w piasku osiadającym na dnie zbiorników wodnych dostarczają więcej tlenu do niższych warstw tych zbiorników. Prowadzi to do osiedlania się większej ilości organizmów w tych rejonach.
Rozgwiazdy powodują, że glony nie osiadają się na rafach koralowych. Jednakże nietypowym gatunkiem jadowitej rozgwiazdy jest korona cierniowa, która powoduje niszczenie Wielkiej Rafy Koralowej.
Szkarłupnie przyczyniają się do kształtowania środowisk wodnych poprzez eksplorowanie otoczenia i pobieranie pokarmu. Wpływają w znacznej mierze w sposób pozytywny na środowisko, w którym żyją.