Fagocytoza odgrywa kluczową rolę w reakcjach odpornościowych jako mechanizm obronny organizmu przed patogenami i innymi substancjami obcymi. Jest to proces, w którym specjalne komórki, zwane fagocytami (makrofagi, neutrofile), pochłaniają i trawią drobnoustroje oraz martwe lub uszkodzone komórki.
Fagocyty posiadają na swojej powierzchni receptory, które są zdolne do rozpoznawania specyficznych struktur obcych, takich jak fragmenty białek bakteryjnych lub przeciwciała przyczepione do powierzchni patogenu. Po rozpoznaniu obcego materiału fagocyty wytwarzają wypustki cytoplazmatyczne, które otaczają i pochłaniają patogen lub inne obce cząsteczki.W ten sposób przyczyniają się do utrzymania homeostazy organizmu i zapobiegają rozwojowi infekcji oraz chorób.