Badanie CRP w diagnostyce różnicowej infekcji przyczynia się do ograniczenia stosowania antybiotyków poprzez umożliwienie rozróżnienia infekcji bakteryjnych od wirusowych na podstawie stężenia tego białka we krwi.W przypadku infekcji bakteryjnych wzmożona synteza CRP powoduje znaczne podwyższenie stężenia tego białka we krwi. Z kolei, w przypadku infekcji wirusowych, stężenie CRP zwykle pozostaje na niższym poziomie lub wzrasta nieznacznie.
Jeśli wynik badania CRP wskazuje na niskie stężenie tego białka, sugerując infekcję wirusową, lekarz może się powstrzymać od przepisania antybiotyku, gdyż nie będzie on skuteczny w zwalczaniu wirusów.