Podczas elekcji w 1587 r. Doszło ponownie do podwójnego wyboru – sprawniejsi zwolennicy Zygmunta III Wazy zorganizowali pod wodzą Jana Zamoyskiego obronę przed zwolennikami kandydata habsburskiego, Maksymiliana i wojskami cesarskimi pokonując ich ostatecznie w bitwie pod Byczyną. W ten sposób szwedzki królewicz mógł kontynuować rządy jako król polski.
Do powołania Zygmunta Wazy na tron polski walnie przyczynił się Jan Zamoyski – który potem nieraz trwał w opozycji do jego rządów.