· W 1945 r. komuniści aresztowali 16 przywódców Polskiego Państwa Podziemnego m.in. Leopolda Okulickiego, Jana Stanisława Jankowskiego, Kazimierza Pużaka. Zostali oni wywiezieni do Moskwy, gdzie odbył się proces pokazowy (proces szesnastu). Oskarżony zarzucono m.in. działanie na szkodę ZSRS i współpracę z III Rzeszą. Aresztowanych skazano na kilkuletnie więzienie, które nie wszyscy przeżyli.
· W sierpniu 1945 r. TRJN ogłosił amnestię – skorzystało z niej ok. 30 tys. żołnierzy podziemia. Wielu z nich aresztowano i zamordowano.
· W lutym 194 r. została ogłoszona druga amnestia, z której skorzystało ok. 75 tys. żołnierzy podziemia oraz osób ukrywających się przed władzą ludową. Ogłoszona amnestia została wykorzystana w celu likwidacji oporu i eliminacji przeciwników.
Komuniści, zdając sobie sprawę z siły i znaczenia oddziałów polskiego podziemia, zaangażowała znaczne siły wojskowe. Do akcji antypartyzanckich przeznaczyli stacjonujące w Polsce oddziały Armii Czerwonej i wojska NKWD, jednostki Ludowego Wojska Polskiego, Korpus Bezpieczeństwa Wewnętrznego, Wojska Ochrony Pogranicza.
Szacuje się, że pod koniec 1945 r. polskie podziemie było zwalczane przez ok. 24 tys. funkcjonariuszy bezpieczeństwa, ok. 100 tys. żołnierzy i milicjantów.