Na schemacie przedstawiono nukleotyd RNA, ponieważ jest w nim obecna ryboza, co odróżnia go od nukletotydu DNA, w którym znajduje się inny cukier prosty – deoksyryboza. Drugą cechą budowy charakterystyczną dla RNA jest uracyl, czyli zasada azotowa, która nie występuje w DNA.
Każdy nukleotyd jest zbudowany z trzech elementów:
- pięciowęglowego cukru – deoksyrybozy lub rybozy
- reszty fosforanowej (V)
- jednej zasady azotowej: adeniny (A), guaniny (G), cytozyny (C) lub tyminy (T). (W RNA zamiast tyminy występuje uracyl).
Nukleotydy są połączone między sobą wiązaniami 3’,5’-fosfodiestrowymi, a ich sekwencja w łańcuchu polinukleotydowym zapisywana jest od końca 5’ do końca 3’.