Genom wewnątrzkomórkowych pasożytów ma niewielkie rozmiary, ponieważ większość substancji, których potrzebują do życia, w tym białka, pobierają z zewnątrz od żywiciela, dlatego nie potrzebują mieć dużej ilości genów kodujących białka.
Geny zawierają informacje potrzebne do wytworzenia białka i są zbudowane z części strukturalnych, u eukariontów są to eksony i introny oraz z części regulatorowych.