Operon tryptofanowy podlega regulacji negatywnej, ponieważ uczestniczy w niej represor, który przyłączając się do promotora, wyłącza transkrypcję genów struktury.
Wyróżniamy dwa typy regulacji aktywności operonu laktozowego: pozytywną i negatywną. Regulacja pozytywna cechuje się obecnością nieaktywnego aktywatora, który uaktywnia się w przypadku małego stężenia glukozy i obecności laktozy w środowisku, natomiast regulacja negatywna polega na stałej obecności aktywnego represora hamującego transkrypcję genów przy dostępie do glukozy.