1. Uzyskiwania odmian bardziej odpornych na warunki środowiska (suszę, chłód)
2. Uzyskiwanie odmian smaczniejszych i bogatszych w składniki odżywcze
3. Uzyskiwanie odmian dających większe plony przy ograniczonym użyciu nawozów. Umożliwia to ograniczenie kosztów uprawy.
4. Rośliny GMO mogą być stosowane do oczyszczania gleb z metali ciężkich np. ołowiu.
5. Rośliny GMO mogą być stosowane do produkcji leków