C. Oddzielenie nici DNA – dwie nici DNA są rozdzielane przez podgrzanie roztworu do temperatury 95°C przez 15 sekund
A. Przyłączenie starterów – w wyniku gwałtownego schłodzenia mieszaniny reakcyjnej do temperatury 54°C startery przyłączają się do nici DNA
B. Synteza DNA – mieszanina reakcyjna zostaje podgrzana do temperatury 72°C, Jest to temperatura odpowiednia do działania polimerazy DNA Taq, która dołącza równocześnie kolejne nukleotydy do obu nici.
