Korzenie spichrzowe - magazynują substancje odżywcze. Są grube i mięsiste na skutek rozrostu miękiszu w korze pierwotnej łyku lub drewnie. Mogą tworzyć tzw. bulwy korzeniowe.
Korzenie czepne — są one dostosowane do wspinania się i zaczepiania rośliny o podpory, jak pnie, gałęzie czy ściany.
Korzenie podporowe — występują u roślin żyjących na terenach podmokłych, o niegłęboki systemie korzeniowym. Dodatkowe korzenie przybyszowe, wyrastają z łodygi i wnikają do gleby, stanowiąc podporę.
Inne modyfikacji korzenia to: korzenie kurczliwe, powietrzne, oddechowe i ssawki.
Korzenie kurczliwe posiadają zdolność do skracania swojej górnej części, uniemożliwiając osadzanie się rośliny głębiej w glebie.
Korzenie powietrzne przybierają formę, która zwisa swobodnie w dół i charakteryzują się skórką o specjalnej budowie, dzięki której mogą pobierać wodę.
Korzenie oddechowe są odgałęzieniami korzeni podziemnych, które wyrastają w górę ponad powierzchnię podłoża i wykazują zdolność do pobierania tlenu.
Ssawki to korzenie rośli pasożytniczych, które służą do pobierania związków z organizmu rośliny żywicielskiej.