Bakterie nitryfikacyjne uczestniczą w obiegu azotu w przyrodzie, utleniając amoniak do łatwo przyswajalnych przez rośliny azotanów.
W reakcji nitryfikacji jony amonowe przekształcane są do związków azotowych łatwo przyswajalnych dla roślin. Związki te są pobierane przez rośliny i wykorzystywane do syntezy makrocząsteczek w ich komórkach.