Opisane reakcje umożliwiają bakteriom zdobywanie odpowiedniego pokarmu i uciekanie od zagrożenia.
Głównym celem chemotaksji jest umożliwienie bakteriom skutecznego znalezienia korzystnych substancji, takich jak substancje odżywcze, oraz uniknięcie szkodliwych substancji, na przykład toksyn.