Wirus grypy szybko mutuje, dlatego przeciwciała wytworzone po zaszczepieniu na dany szczep wirusa, mogą okazać się nieskuteczne w walce z nową formą wirusa w kolejnym roku.
Przeciwciała rozpoznają konkretne antygeny na powierzchni wirusa. Z powodu szybkich mutacji wirusa grypy, właściwości jego antygenów zmieniają się. Szczepionka, która spowodowała powstanie przeciwciał przeciwko antygenom wirusa w jednym roku, często okazuje się nieskuteczna w kolejnym roku i trzeba ponowić szczepienie na nową formę wirusa.