Bakterie nazywane są organizmami wszędobylskimi, ponieważ są obecne w praktycznie każdym miejscu na Ziemi i występują w prawie każdych warunkach środowiska.
Bakterie są obecne praktycznie wszędzie: na ziemi, w glebie, w wodzie, powietrzu, a nawet we wnętrzu i na powierzchni ciała innych organizmów.