Sędziów do Trybunału Koronnego wybierano co roku na sejmikach. Z każdego województwa przysługiwało jedno miejsce oprócz wymienionych (m.in. z województwa płockiego po dwóch, a z mazowieckiego trzech).
Stefan Batory był zmuszony do zrzeczenia się części swoich uprawnień sądowych na rzecz Trybunału Koronnego oraz Trybunału Litewskiego. Nowo powstałe instytucje przejęły sprawy dotyczące odwołań od wyroków podjętych przez sądy niższych instancji.