Plany budowy strunowców i bezkręgowców różnią się lokalizacją głównych narządów wewnętrznych. Bezkręgowce na środku mają układ pokarmowy, powyżej niego znajdują się główne tętniące naczynia krwionośne, a poniżej niego znajduje się układ nerwowy. Strunowce również posiadają układ pokarmowy na środku, jednak powyżej niego znajdują się układ nerwowy i pomiędzy nimi szkielet osiowy, a główne tętniące naczynia krwionośnie znajdują się poniżej.
Strunowce to zwierzęta, które w czasie ewolucji wykształciły łącznotkankową strunę grzbietową. Pełni ona funkcję szkieletu wewnętrznego.
Są to zwierzęta zaliczane do trójwarstwowców, są też wtórouste i wtórnojamowcowe, ponieważ posiadają celomę.