1- wiązanie 3’,5’-fosfodiestrowe
2- wiązanie wodorowe
Wiązaniem 3’,5’-fosfodiestrowym połączony jest cukier jednego nukleotydu zresztą fosforanową(V) drugiego nukleotydu. Natomiast wiązaniami wodorowymi połączone są zasady azotowe dwóch łańcuchów polinukleotydowych.