Rozłam w Kościele spowodował wybuch wielu konfliktów między innymi na tle religijnym. Spory między cesarzem katolickim a luteranami zakończyły się w 1555 roku podpisaniem pokoju w Augsburgu. Wprowadzono wtedy zasadę: „czyja władza, tego religia”. Oznaczało to, że aktualnie panujący władca miał prawo narzucić swoją wiarę wszystkim poddanym.
W następstwie wprowadzenia tej zasady społeczeństwo niemieckie podzieliło się na część katolicką i protestancką.