Zielona chemia pozwala na redukcję lub eliminację stosowania oraz produkowania substancji niebezpiecznych. Przemysł to ogromna gałąź gospodarki i znaczący procent zanieczyszczeń otoczenia pochodzi właśnie z fabryk czy zakładów. Stosowanie się do zasad zielonej chemii pozwala na zapobieganie rozprzestrzenianiu się substancji szkodliwych, które są niebezpieczne zarówno dla ludzi, jak i roślin oraz zwierząt. Zapobiega to rozwojowi chorób człowieka, takich jak astma, alergie czy pylice, ale też ogranicza śmiertelność pozostałych elementów natury.