Wody powierzchniowe zanieczyszczane są przez ścieki komunalne i przemysłowe, wycieki z przemysłowych instalacji i zanieczyszczenia z pól uprawnych w postaci nawozów i środków ochrony roślin. Zanieczyszczenia wód możemy zatem wyeliminować poprzez edukację zarówno personelu fabryk, jak i rolników. Najistotniejsze jest jednak budowanie lokalnych oczyszczalni ścieków. Warto też stosować nawozy i środki ochrony roślin, które nawet po dostaniu się do środowiska nie wywołują dużych szkód dla zwierząt czy roślin.
