Życie na morzu, dla uczestników wyprawy Magellana nie było łatwe. Marynarze zmuszeni byli do spożywania marnej jakości żywności m.in. stare suchary starte z insektami. Pili wodę, która nie była zdatna do picia. Wielu z nich chorowało na silne obrzęki górnych i dolnych dziąseł.
W dzisiejszych czasach takie objawy są charakterystyczne dla szkorbutu, wywołanego niedoborem witaminy C. Wielu z nich cierpiało na innego rodzaju schorzenia.
Wyprawa Magellana była bardzo dużym, odważnym, ale i niebezpiecznym przedsięwzięciem. Brak dostatecznego doświadczenia w dalekomorskich podróżach skutkowała licznymi katastrofami.