Trypsyna jest produkowana i wydzielana w formie nieaktywnego trypsynogenu w celu ochrony tkanki trzustki przed samo-trawieniem.
Samoistne aktywowanie trypsyny wewnątrz trzustki może prowadzić do uszkodzenia tkanek i powstania stanu zapalnego. Wytwarzanie trypsyny w postaci nieaktywnej chroni trzustkę przed działaniem jej własnego enzymu, dopóki nie zostanie ona uwalniana do dwunastnicy.