Szlachta silnie popierała kandydaturę Stefana Batorego. Był on bowiem wspaniałą alternatywą dla popieranego przez magnaterię cesarza.
Rola Zamoyskiego była znacząca. To on powstrzymał przyjazd cesarza, a jego poparcie stało się kluczowe do osadzenia Batorego na polskim tronie.
Jan Zamoyski w trakcie rządów Stefana Batorego urósł do wysokiej pozycji – był de facto drugą najważniejszą osobą w państwie. Posiadał on nawet własne miasto zbudowane w stylu renesansowym – Zamość.