Konfederacja barska, mimo że była to szlachetna próba obrony suwerenności Polski, przyniosła niestety wiele negatywnych skutków.
Najważniejszym problemem było to, że konfederaci nie byli w stanie zjednoczyć się wokół wspólnego celu. Wszyscy byli zgodni co do konieczności obrony suwerenności Polski, ale różnili się w kwestii tego, jak to osiągnąć. Niektórzy chcieli skupić się na walce z Rosją, inni na reformie wewnętrznej. Ta dezorganizacja doprowadziła do wielu nieudanych prób przeciwdziałania rosnącej dominacji Rosji.
Konfederaci byli także słabo zorganizowani i nie mieli wystarczających zasobów, aby skutecznie stawić czoła zawodowej i zorganizowanej armii rosyjskiej. Brakowało im zarówno pieniędzy, sprzętu, doświadczenia oraz ludzi, dowódców i inżynierów.
Walki chaos, które towarzyszyły działaniom konfederatów, doprowadziły do zniszczenia wielu miast i wsi, a także do utraty wielu cennych zasobów. W efekcie, kraj stał się jeszcze bardziej podatny na zewnętrzne naciski.