W powstawaniu wiązania wodorowego bierze udział obdarzony ładunkiem dodatnim atom wodoru jednej cząsteczki oraz obdarzony ładunkiem dodatnim atom drugiej cząsteczki.
Siły van der Waalsa powstają w wyniku przemieszczania się elektronów, co prowadzi do powstania lokalnych obszarów z dodatnimi i ujemnymi ładunkami.