Wiązania wodorowe odgrywają rolę w stabilizacji struktury przestrzennej makrocząsteczek jak białka, kwasy nukleinowe.
W powstawaniu wiązania wodorowego bierze udział obdarzony ładunkiem dodatnim atom wodoru jednej cząsteczki oraz obdarzony ładunkiem dodatnim atom drugiej cząsteczki.
Drugim wiązaniem również biorącym udział w utrzymywaniu struktury przestrzennej makrocząsteczek są siły van der Waalsa.