W wyniku ugody perejasławskiej Rzeczpospolita utraciłaby kontrolę nad ukraińskimi ziemiami, które oddano pod władzę cara Rosji. To osłabiłoby jej pozycję na wschodzie Europy, a także uderzyło we wpływy polskiej magnaterii posiadającej tam folwarki. Ugoda przyczyniłaby się do nasilenia napięć narodowo-religijnych w Rzeczypospolitej, gdyż szlachta i magnateria uważałaby Rusinów i ludność prawosławną za wrogą i niebezpieczną dla jedności państwa.
Ugoda perejasławska przyczyniłaby się do pogorszenia stosunków między Rzecząpospolitą a Rosją, a przyłączenie ukraińskich ziem do niej, stałoby się pretekstem do kolejnej wojny. To spowodowałoby eskalację lokalnego konfliktu z kozakami, wplątałoby Rzeczpospolitą w wycieńczający spór i osłabiło pozycję na arenie międzynarodowej. W wyniku ugody perejasławskiej Rosja zyskałaby większy wpływ na Ukrainę, co wpłynęło na zmianę układu sił w regionie, a zatem osłabienia Rzeczypospolitej, co miałoby długotrwałe konsekwencje dla sytuacji politycznej i terytorialnej w Europie Wschodniej.
Wprowadzenie w życie postanowień ugody perejasławskiej spowodowało znaczące zmiany w sytuacji Rzeczypospolitej, przyczyniając się do wewnętrznych podziałów i konfliktów oraz zaostrzenia relacji z Rosją.