Armia rosyjska próbowała tłumić zapędy konfederatów barskich w zarodku, jednak te ciągle się odradzały na terenie całej Rzeczpospolitej. Nie pomogło im to w zwycięstwie, ponieważ rozproszonym oddziałom brakowało zjednoczenia i liczebności – wobec tego były łatwym celem dla wroga. Wojska były niewyszkolone nieumiejętnie dowodzone, brakowało im też dyscypliny. Ponadto Rosja w każdej chwili mogła wezwać sprzymierzone Prusy oraz Austrię.
W wyniku prześladowań ze strony wojsk rosyjskich około 10 tysięcy ludzi, którzy popierali konfederację barską, zostało zesłanych w głąb Syberii. Konfederacja barska odegrała ważną rolę w historii Polski, jako jeden z pierwszych zorganizowanych ruchów oporu przeciwko zaborcom i próbom narzucenia obcych rządów. Wpłynęła także na kształtowanie się polskiego patriotyzmu i narodowej świadomości.